Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDARQ9UNE0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDARQ9UNE0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDARQ9UNE0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDARQ9UNE0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDARQ9UNE0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDARQ9UNE0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms