Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms