Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHIPQ96QV1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HHIPQ96QV1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms