Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms