Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC29A4Q7RTT9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC29A4Q7RTT9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms