Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USPL1Q5W0Q7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms