Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms