Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MICAQ29983 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms