Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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