Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
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COL9A3Q14050 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL9A3Q14050 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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