Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE3BQ13370 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE3BQ13370 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
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