Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL16A1Q07092 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms