Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms