Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPIBQ01892 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPIBQ01892 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms