Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX1P83916 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBX1P83916 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX1P83916 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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