Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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