Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP7BP35670 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP7BP35670 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms