Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB9P28065 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms