Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYF6P23409 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYF6P23409 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYF6P23409 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYF6P23409 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYF6P23409 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYF6P23409 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYF6P23409 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MYF6P23409 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MYF6P23409 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms