Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF1BP20333 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms