Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHGAP10645 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHGAP10645 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHGAP10645 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHGAP10645 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHGAP10645 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHGAP10645 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms