Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms