Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IQSEC3Q9UPP2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms