Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms