Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms