Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB6BQ9NRW1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms