Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
WDR53Q7Z5U6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms