Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGCBQ16585 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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