Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FOXE3Q13461 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FOXE3Q13461 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXE3Q13461 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXE3Q13461 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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