Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLAMF1Q13291 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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