Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCP2Q13094 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms