Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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