Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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TMEM258P61165 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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TMEM258P61165 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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TMEM258P61165 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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TMEM258P61165 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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TMEM258P61165 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TMEM258P61165 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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