Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2NP61088 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms