Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKX2-5P52952 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NKX2-5P52952 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-5P52952 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-5P52952 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-5P52952 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-5P52952 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-5P52952 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-5P52952 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-5P52952 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-5P52952 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-5P52952 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-5P52952 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-5P52952 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NKX2-5P52952 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms