Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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