Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4E171 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4E171 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4E171 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4E171 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4E171 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4E171 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4E171 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4E171 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4E171 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4E171 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4E171 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4E171 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4E171 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4E171 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4E171 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4E171 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms