Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms