Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.42■□□□□ 0.386e-25■■■■■ 150.9
UTP3Q9NQZ2 TRIM41-206ENST00000514219 459 ntTSL 516.96■□□□□ 0.316e-25■■■■■ 150.9
UTP3Q9NQZ2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.266e-25■■■■■ 150.9
UTP3Q9NQZ2 PLD3-202ENST00000359274 745 ntTSL 316.35■□□□□ 0.216e-25■■■■■ 150.9
UTP3Q9NQZ2 PLD3-208ENST00000464586 253 ntTSL 1 (best)8.81□□□□□ -16e-25■■■■■ 150.9
UTP3Q9NQZ2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.254e-7■■■■■ 150.9
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.068e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 MAP4K2-210ENST00000470088 1805 ntTSL 525.03■■□□□ 1.68e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 MAP4K2-203ENST00000424945 1175 ntTSL 523.23■■□□□ 1.318e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.138e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-203ENST00000437486 622 ntTSL 521.76■■□□□ 1.078e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.068e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.978e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.928e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-204ENST00000446141 2085 ntTSL 220.34■□□□□ 0.858e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 PKP3-204ENST00000526971 532 ntTSL 220.31■□□□□ 0.848e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.828e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 COX19-202ENST00000457254 1420 ntTSL 217.91■□□□□ 0.468e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-214ENST00000495686 586 ntTSL 417.83■□□□□ 0.448e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-213ENST00000488527 584 ntTSL 516.42■□□□□ 0.228e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-209ENST00000463358 595 ntTSL 315.93■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 NEDD4L-220ENST00000587881 1984 ntTSL 515.38■□□□□ 0.058e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-202ENST00000435943 559 ntTSL 514.31□□□□□ -0.128e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-207ENST00000453823 560 ntTSL 413.63□□□□□ -0.238e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-208ENST00000454383 576 ntTSL 413.27□□□□□ -0.298e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 EPHA6-201ENST00000389672 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.318e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADAP1-210ENST00000477906 579 ntTSL 313.06□□□□□ -0.328e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 GAS8-218ENST00000569399 856 ntTSL 212.82□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 GLE1-202ENST00000372770 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.714e-8■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.581e-6■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.321e-6■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 P3H1-207ENST00000460031 2726 ntTSL 518.65■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 P3H1-214ENST00000495874 2813 ntTSL 217.48■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 150.8
UTP3Q9NQZ2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 150.7
UTP3Q9NQZ2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 150.7
UTP3Q9NQZ2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 150.7
UTP3Q9NQZ2 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 150.7
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.743e-8■■■■■ 150.7
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.743e-8■■■■■ 150.7
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.713e-8■■■■■ 150.7
UTP3Q9NQZ2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 150.7
UTP3Q9NQZ2 MXRA8-208ENST00000476718 1001 ntTSL 317.36■□□□□ 0.379e-9■■■■■ 150.6
UTP3Q9NQZ2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.898e-9■■■■■ 150.6
UTP3Q9NQZ2 CD81-215ENST00000530648 558 ntTSL 415.03■□□□□ -03e-6■■■■■ 150.6
UTP3Q9NQZ2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.486e-8■■■■■ 150.6
UTP3Q9NQZ2 EVI5-204ENST00000474806 525 ntTSL 322.15■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 150.6
UTP3Q9NQZ2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.096e-8■■■■■ 150.6
UTP3Q9NQZ2 BCOR-206ENST00000406200 4216 ntTSL 210.64□□□□□ -0.716e-8■■■■■ 150.6
UTP3Q9NQZ2 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 150.6
UTP3Q9NQZ2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.638e-7■■■■■ 150.5
UTP3Q9NQZ2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.188e-7■■■■■ 150.5
UTP3Q9NQZ2 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.058e-7■■■■■ 150.5
UTP3Q9NQZ2 SOD2-204ENST00000401980 523 ntTSL 413.69□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 150.5
UTP3Q9NQZ2 SOD2-214ENST00000545162 571 ntTSL 312.93□□□□□ -0.348e-7■■■■■ 150.5
UTP3Q9NQZ2 DLEU2-204ENST00000433070 698 ntTSL 1 (best)12.43□□□□□ -0.428e-7■■■■■ 150.5
UTP3Q9NQZ2 DLEU2-207ENST00000458725 1657 ntTSL 212.21□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 150.5
UTP3Q9NQZ2 SOD2-210ENST00000537657 507 ntTSL 211.23□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 150.5
UTP3Q9NQZ2 AL669831.3-203ENST00000419394 491 ntTSL 58.58□□□□□ -1.048e-7■■■■■ 150.5
UTP3Q9NQZ2 AL669831.3-209ENST00000440200 413 ntTSL 57.92□□□□□ -1.148e-7■■■■■ 150.5
UTP3Q9NQZ2 RAB8B-203ENST00000558990 643 ntTSL 48.97□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 150.5
UTP3Q9NQZ2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.879e-8■■■■■ 150.4
UTP3Q9NQZ2 RAP1GAP-208ENST00000464457 409 ntTSL 38.88□□□□□ -0.999e-7■■■■■ 150.4
UTP3Q9NQZ2 DUS1L-215ENST00000582529 1212 ntTSL 528.13■■■□□ 2.096e-8■■■■■ 150.3
UTP3Q9NQZ2 WDR26-206ENST00000479778 2552 ntTSL 25.48□□□□□ -1.533e-30■■■■■ 150.3
UTP3Q9NQZ2 PRKAR1B-207ENST00000430040 1006 ntTSL 318.1■□□□□ 0.498e-7■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 AP2A1-204ENST00000594838 611 ntTSL 316.92■□□□□ 0.33e-8■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.178e-7■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 VAPB-203ENST00000463370 2393 ntTSL 213.96□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 AL137782.1-201ENST00000563635 4128 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 FBXO31-204ENST00000565593 2717 ntTSL 521.59■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 150.2
UTP3Q9NQZ2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 12e-6■■■■■ 150.1
UTP3Q9NQZ2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 150.1
UTP3Q9NQZ2 NDST1-208ENST00000524161 437 ntTSL 216.17■□□□□ 0.188e-7■■■■■ 150.1
UTP3Q9NQZ2 ACTG1-204ENST00000571721 813 ntTSL 519.92■□□□□ 0.783e-17■■■■■ 149.9
UTP3Q9NQZ2 ACTG1-209ENST00000575659 742 ntTSL 317.98■□□□□ 0.473e-17■■■■■ 149.9
UTP3Q9NQZ2 ACTG1-202ENST00000570382 471 ntTSL 413.89□□□□□ -0.193e-17■■■■■ 149.9
UTP3Q9NQZ2 ACTG1-211ENST00000575994 856 ntTSL 313.74□□□□□ -0.213e-17■■■■■ 149.9
UTP3Q9NQZ2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.855e-8■■■■■ 149.9
UTP3Q9NQZ2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.515e-8■■■■■ 149.9
UTP3Q9NQZ2 MICALL2-214ENST00000493998 404 ntTSL 213.62□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 149.9
UTP3Q9NQZ2 HOXB6-204ENST00000490419 468 ntTSL 310.92□□□□□ -0.665e-8■■■■■ 149.9
UTP3Q9NQZ2 RNF130-204ENST00000520911 1790 ntTSL 1 (best)30.46■■■□□ 2.471e-6■■■■■ 149.9
UTP3Q9NQZ2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 12e-6■■■■■ 149.9
UTP3Q9NQZ2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.514e-7■■■■■ 149.9
UTP3Q9NQZ2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.694e-7■■■■■ 149.9
UTP3Q9NQZ2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.982e-9■■■■■ 149.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35B1-209ENST00000507773 1320 ntTSL 520.93■□□□□ 0.942e-9■■■■■ 149.8
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1669.3 ms