Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC106Q9BWC9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC106Q9BWC9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms