Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BPIFA3Q9BQP9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms