Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms