Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms