Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC9Q8TBE3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms