Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARMIL3Q8ND23 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms