Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF7Q6Q0C0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms