Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD2Q6P5Q4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms