Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALFQ53S48 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms