Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms