Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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HIST2H2BEQ16778 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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HIST2H2BEQ16778 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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HIST2H2BEQ16778 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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HIST2H2BEQ16778 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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HIST2H2BEQ16778 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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HIST2H2BEQ16778 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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HIST2H2BEQ16778 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HIST2H2BEQ16778 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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HIST2H2BEQ16778 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HIST2H2BEQ16778 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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HIST2H2BEQ16778 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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